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國光客運台北西站將於年底，配合台北市政府西區門戶計畫拆除，25條客運路線也將從下個月起陸續遷到台北轉運站及台北車站周邊停靠。不過由於國光客運向市政府索賠新台幣3億5千萬元，但市政府最多只想拿出5千萬元拆遷補償費。對此，國光客運表示，不排除提起訴訟，爭取應有的權益。

配合台北市政府西區門戶計畫，國光客運長期向台北市政府租用的台北西站A、B棟大樓，確定將於11月1日開始動工拆除，改建為綠地廣場；25條客運路線也將在9月、10月分別搬遷到台北轉運站及台北車站周邊停靠。

不過由於國光客運向台北市政府索賠新台幣3億5千萬元，台北市政府認為，依照契約，如果是因為國家政策或都市計畫，政府可隨時終止契約，國光客運不得要求任何賠償，但市政府按照「公共工程拆遷補償自治條例」評估國光客運重建成本、搬遷過程營業損失等，依然編列5千萬元拆遷補償費給國光客運。

對此，國光客運表示，當初標下台北西站，國光繳給中央1億5千多萬元，雖然歷經政府更迭，這筆錢還是應還給國光，不排除提起訴訟，爭取應有的權益。國光客運副董事長王應傑說：『(原音)基於「商不跟官鬥」的立場，所以我們完全配合台北市政府。但是因為在國光民營化以前，是由我們所有的司機跟員工組成的國光汽車客運公司，一人投資(新台幣)30萬，就跟中華民國當時交通部所屬的台灣汽車客運，買了現在這個西站的地上物，這個1億5千多萬的錢沒有補償我們，我們是一定會訴諸於這個法院提告的啦！』

王應傑指出，國光客運從未如媒體所報導，漫天向市政府索賠新台幣7億元的天價。當年國光應郝龍斌政府要求，投入了2億元興建的A棟大樓，如今柯文哲說拆就拆，還拿出前朝政府的契約，表示可以不用賠一毛錢。因此，國光也會另外控告市政府任意剝奪人民財產作為違憲，討回這2億元。